Ngay từ những phiên bản đầu tiên Unikey đã hỗ trợ rất nhiều bảng mã tiếng Việt (Vietnamese) bao gồm: Unicode dựng sẵn, Unicode tổ hợp, TCVN3 (ABC), VNI Windows, BK HCM1, BK HCM2, Vietware-X, Vietware-F, VPS, VISCII… Tuy nhiên dần dần theo thời gian, một số bảng mã đã không còn phổ biến, thậm chí rất hiếm khi được nhắc đến. Vì vậy nếu bạn là người dùng mới hay dân văn phòng bạn chỉ cần quan tâm tới 2 bảng mã duy nhất: Unicode dựng sẵn và TCVN3 (ABC).
Ngoài hỗ trợ những bảng mã tiếng Việt ở trên, Unikey còn là một công cụ đắc lực cho dân lập trình vì nó cho phép bạn gõ những chuỗi ký tự dựa trên một số phương pháp mã hóa Unicode khá đặc biệt như: X UTF-8, UTF-8 Literal, NCR Decimal, NCR Hexadecimal, NCR Hex, Unicode C String.
Unikey cũng hỗ trợ chuẩn tiếng Việt của hãng Microsoft (Vietnamese locale CP 1258) – một bảng mã ít thông dụng nhưng hỗ trợ khá tốt cho các ký tự tiếng Việt xuất hiện trong các form nhập liệu, viết macro, lập trình Visual Basic trên bộ Microsoft Office như Word, Excel, Access…
Unikey Hỗ trợ 5 kiểu gõ tiếng Việt, đánh tiếng Việt – Vietnamese thông dụng nhất: TELEX, VNI, VIQR, kiểu Microsoft và kiểu tự định nghĩa. Hầu hết người miền Bắc ưa thích kiểu gõ Telex, người miền Nam thì ưa thích kiểu gõ VNI, các kiểu còn lại thì ít phổ biến.